Pape Omar đến câu lạc bộ Hà Nội thi đấu từ mùa giải 2019 sau 5 năm gắn bó với Thanh Hóa. Cầu thủ người Senegal nhanh chóng để lại dấu ấn ngay mùa giải đầu tiên với 15 bàn thắng ở đấu trường V-League và 8 bàn tại đấu trường AFC Cup.
Tuy nhiên, bước sang mùa giải 2020, anh không còn thể hiện được nhiều do dính chấn thương sụn chêm đầu gối. Cầu thủ sinh năm 1987 chỉ ghi được vỏn vẹn 2 bàn ở giải quốc nội và ra sân chính thức 6/14 trận cho đội bóng áo tím.
Sau khi kết thúc hợp đồng có giá trị 2 năm, Omar không được gia hạn do không đảm bảo về chuyên môn. Nhiều khả năng anh sẽ về quê nhà để phẫu thuật dứt điểm chấn thương gặp phải trước khi nghĩ đến một bến đỗ mới.
Còn về phía CLB Hà Nội, HLV Chu Đình Nghiêm sau khi chia tay Omar cũng đang lên kế hoạch tái thiết hàng công với những cái tên như Genvane, Pedro Paole, Bruno Cunha,... được nhắm đến. Chưa rõ cái tên nào sẽ cập bến sân Hàng Đẫy trong thời gian tới.