Ông Nông Quốc Tuấn từng giữ chức Phó Chủ nhiệm Uỷ ban Dân tộc từ năm 2008. Sau đó, ông được luân chuyển giữ chức Phó Bí thư Tỉnh uỷ tỉnh Bắc Giang, rồi Bí thư Tỉnh uỷ tỉnh Bắc Giang. Tại Đại hội Đảng lần thứ XI đầu năm 2011, ông Nông Quốc Tuấn được bầu vào Ban chấp hành Trung ương.
Năm 2012, Thủ tướng ký quyết định số 689/QĐ-TTg, điều động, bổ nhiệm ông giữ chức vụ Phó chủ nhiệm Ủy ban Dân tộc.
Hiện nay, Thứ trưởng, Phó Chủ nhiệm Ủy ban Dân tộc Nông Quốc Tuấn thực hiện nhiệm vụ Bí thư Đảng ủy cơ quan Ủy ban Dân tộc. Giúp Bộ trưởng, Chủ nhiệm Ủy ban Dân tộc theo dõi, chỉ đạo các nhiệm vụ: Tham mưu giúp Bộ trưởng, Chủ nhiệm quy trình, trình tự thủ tục về công tác cán bộ thuộc thẩm quyền của Ban Cán sự Đảng trước khi trình Ban Cán sự Đảng xem xét, quyết định; ký các văn bản trao đổi về công tác cán bộ với các bộ, ban, ngành, địa phương sau khi có ý kiến của Ban Cán sự Đảng, tập thể Lãnh đạo Ủy ban hoặc của đồng chí Bộ trưởng, Chủ nhiệm; chỉ đạo các hoạt động của Văn phòng Ủy ban, Văn phòng Ban Cán sự đảng và Đảng ủy; công nghệ thông tin, xây dựng Chính phủ điện tử; cải cách hành chính; thực hiện Quy chế dân chủ ở cơ sở; làm nhiệm vụ Chủ tịch Hội đồng lương.
Thứ trưởng, Phó Chủ nhiệm Ủy ban Dân tộc Nông Quốc Tuấn phụ trách các đơn vị: Vụ Địa phương II, Văn phòng Ủy ban (Bao gồm cả Đại diện Văn phòng tại Thành phố Hồ Chí Minh), Văn phòng Ban Cán sự đảng và Đảng ủy, Trung tâm Thông tin; chỉ đạo, theo dõi công tác dân tộc ở các tỉnh: Quảng Nam, Quảng Ngãi, Bình Định, Phú Yên, Khánh Hòa, Kon Tum, Gia Lai, Đắk Lắk, Đắk Nông, Lâm Đồng, Đồng Nai, Bình Dương, Bình Phước, Tây Ninh, Long An, Bà Rịa - Vũng Tàu.
