Trong quá trình tự đánh giá, trường đã xây dựng các hoạt động của mình, căn cứ vào bộ tiêu chuẩn đánh giá chất lượng giáo dục trường đại học do Bộ Giáo dục - Đào tạo (Bộ GD-ĐT) ban hành năm 2007 và theo Tiêu chuẩn đánh giá chất lượng giáo dục trường đại học của Bộ GD-ĐT ban hành năm 2014.
Tháng 3.2016, Trường hoàn thành công tác tự đánh giá và đã đề nghị tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục độc lập, đó là Trung tâm Kiểm định chất lượng giáo dục – Đại học Quốc gia TPHCM tiến hành đánh giá ngoài.
Sau khi đánh giá và thẩm định, Hội đồng Kiểm định chất lượng giáo dục đã công nhận trường Đại học Công nghiệp Thực phẩm TPHCM đạt tiêu chuẩn chất lượng giáo dục với tỷ lệ số tiêu chí đạt yêu cầu: 80,33%.
Ông Nguyễn Xuân Hoàn, Phó Hiệu trưởng nhà trường cho rằng, việc đạt chuẩn kiểm định chất lượng giáo dục mới chỉ là bước khởi đầu cho việc khẳng định chất lượng đào tạo của trường. Xu hướng hội nhập đòi hỏi nhà trường phải duy trì và cải tiến chất lượng thường xuyên.
