Tại vòng 3 V.League 2020, trận đấu mà Dược Nam Hà Nam Định để thua Viettel 1-2 đã để lại nhiều vấn đề nổi cộm trong công tác trọng tài. Tình huống đáng chú ý nhất diễn ra ở phút 78, trung vệ Lâm Anh Quang đã vào bóng quá quyết liệt với Bruno của Viettel và bị trọng tài chính rút thẻ đỏ trực tiếp.
Quyết định này và tình huống không phạt thẻ đỏ với pha bỏ bóng đá chân của tiền đạo Viettel để trả đũa cầu thủ Nam Định đã nhận phải sự phản đối gay gắt của ban huấn luyện, các cầu thủ và cổ động viên.
Sau khi kết thúc trận đấu, nhiều cổ động viên quá khích của Nam Định đã ném vật thể lạ xuống sân để phản đối các quyết định của trọng tài.
Đến vòng đấu thứ 4, Nam Định tiếp tục có những phản ứng với các quyết định trọng tài sau trận thua Hoàng Anh Gia Lai 0-1.
Huấn luyện viên Nguyễn Văn Dũng đã nói rằng: "Hình như đội Nam Định đi đâu cũng vậy, đá đâu cũng vậy cũng bị trọng tài thổi bất lợi. Tôi không nói sức ép nhưng những tình huống phạm lỗi của đội chủ nhà thì không thổi, cầu thủ Nam Định chỉ cần chạm nhẹ là bị cắt còi, rất bị ức chế.
Ví dụ như tình huống nằm sân của Bửu Ngọc, cậu ta cố tình câu giờ chứ Merlo vào không va chạm. Trong bóng đá, thủ môn lăn lộn là thủ thuật câu giờ của thủ môn. Hoàng Anh Gia Lai lúc đó đang thắng nên câu giờ là điều bình thường".
Trong trận đấu giữa Nam Định và Hoàng Anh Gia Lai, trọng tài Nguyễn Minh Thuận tỏ ra non tay khi không xử lý quyết liệt với nhiều tình huống phạm lỗi, dẫn đến những phản ứng từ ban huấn luyện. Bên cạnh đó, dù có thời điểm cả ban huấn luyện của Nam Định và Hoàng Anh Gia Lai đều phản ứng nhưng không có thẻ phạt nào được đưa ra.
Đến trận TP.HCM gặp Sài Gòn, trọng tài chính Nguyễn Viết Duẩn cũng nhận phải phản ứng rất gay gắt từ ban huấn luyện TPHCM. Huấn luyện viên Chung Hae-seong và trợ lý Lư Đình Tuấn đều nhận thẻ vàng nhưng việc trọng tài không theo sát hết các tình huống dẫn đến nhiều lỗi bị bỏ qua. Tiền đạo Công Phượng liên tục khiếu nại về việc bị đối phương chơi tiểu xảo.
Thực tế, ở mùa giải 2020, V.League không có sự phục vụ của nhiều trọng tài kinh nghiệm, chất lượng. Theo Trưởng Ban Trọng tài VFF Dương Văn Hiền thì các trọng tài Hoàng Phạm Công Khanh, Nguyễn Phương Nam, Nguyễn Trung Kiên cùng 3 người từng đạt danh hiệu FIFA là Nguyễn Hiền Triết, Nguyễn Trọng Thư, Trương Hồng Vũ không làm nhiệm vụ ở V.League 2020.
Ngoài 6 trọng tài có kinh nghiệm đó còn có thêm 4 trợ lý trọng tài không vượt qua được sát hạch thể lực. V.League 2020 chỉ còn 2 trọng tài có đẳng cấp FIFA là Ngô Duy Lân và Hoàng Ngọc Hà.
Việc nhiều trọng tài "non tay" điều hành V.League dễ dẫn đến những vấn đề tâm lý khi gặp các đội bóng có phản ứng thái quá.
