U16 nữ quốc gia năm 2020 sau nhiều lần trì hoãn vì dịch COVID-19 cũng đã được tổ chức tại trung tâm đào tạo bóng đá trẻ Việt Nam VFF. Số đội tham dự được rút xuống còn 4 đội gồm: Dự tuyển quốc gia, Hà Nội Watabe, Phong Phú Hà Nam và Sơn La.
Các đội tham dự thi đấu theo thể thức đá vòng tròn lượt đi, lượt về để tìm ra nhà vô địch từ ngày 20/10. Trở lại giải đấu, U16 dự tuyển quốc gia và Phong Phú Hà Nam là 2 đội được đánh giá cao nhất.
Cả hai đội đều có màn trình diễn đúng như kỳ vọng khi vượt qua U16 Hà Nội Watabe và U16 Sơn La để tạo ra cuộc đua song mã kịch tính tới vòng đấu áp chót. Trận đấu giữa Dự tuyển quốc gia và Phong Phú Hà Nam diễn ra hấp dẫn với thế trận cởi mở, cống hiến.
Kết thúc, U16 dự tuyển quốc gia giành chiến thắng 4-3 và đăng quang sớm hơn 1 vòng đấu. U16 Phong Phú Hà Nam cũng chắc chắn với vị trí Á quân giải đấu, còn U16 Hà Nội Watabe giành vị trí thứ 3.