Nội dung vụ án được biết, từ năm 2016 đến tháng 9.2017, trong quá trình thực hiện dự án khu dân cư phía bắc khu đô thị mới Nam thành phố Tuy Hòa, Nguyễn Chí Hiến - Phó Chủ tịch Thường trực UBND tỉnh kiêm Giám đốc Sở Tài chính tỉnh Phú Yên (thôi kiêm nhiệm Giám đốc Sở Tài chính từ ngày 7.6.2017), Chủ tịch Hội đồng đấu giá quyền sử dụng đất Khu dân cư phía bắc khu đô thị mới nam thành phố Tuy Hòa - trực tiếp chỉ đạo thực hiện, được sự giúp sức và thực hành của Nguyễn Thị Nở - Phó Giám đốc Thường trực Sở Tài chính (được phân công Phó giám đốc phụ trách Sở Tài chính từ ngày 7.6.2017); Mai Hắc Lợi - Phó Giám đốc Sở Tư pháp, Phó Chủ tịch thường trực Hội đồng đấu giá quyền sử dụng đất Khu dân cư phía Bắc của khu đô thị mới Nam thành phố Tuy Hòa; Nguyễn Ngọc Duy - Phó Cục trưởng Cục thuế tỉnh; Ngô Quang Phú - Phó Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường đã thực hiện việc bán đấu giá quyền sử dụng 262 lô đất, cho phép hỗ trợ giảm giá 5% trái quy định pháp luật, gây thiệt hại tài sản Nhà nước với số tiền 8.043.765.000 đồng.
Như thông tin Báo Lao Động đã đưa tin trước đó, tháng 6.2016, để trả khoản nợ 200 tỉ đồng tạm ứng của Kho bạc Nhà nước trong nhiều năm trước làm hạ tầng, UBND tỉnh Phú Yên chỉ đạo thực hiện dự án hạ tầng kỹ thuật khu đô thị mới Nam TP.Tuy Hòa (giai đoạn 1). Tỉnh đầu tư gần 319 tỉ đồng để làm hạ tầng, phân thành 458 lô nhà ở. Trong đó, 262 lô nhà ở liền kề, còn lại là các lô biệt thự.
Năm 2017, một doanh nghiệp trúng thầu khu 262 lô nhà ở liền kề, giá 162,495 tỉ đồng. Ông Nguyễn Chí Hiến đã ký quyết định dùng ngân sách Nhà nước hỗ trợ chủ doanh nghiệp trúng đấu giá hơn 8 tỉ đồng.
Ngày 4.11.2020, Công an tỉnh Phú Yên tiếp nhận giải quyết tố giác tội phạm của công dân về việc cho phép giảm 5% tiền bán đấu giá 262 lô đất ở Khu đô thị mới Nam TP.Tuy Hòa trái quy định pháp luật, gây thiệt hại tài sản Nhà nước. Cơ quan chức năng vào cuộc điều tra, xác minh.
Tháng 5.2021, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Phú Yên khởi tố vụ án "Vi phạm các quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí" theo khoản 3 Điều 219 Bộ luật Hình sự, trong vụ bán đấu giá sỉ 262 lô đất tại Khu đô thị mới Nam Tuy Hòa.
