Báo cáo về quy hoạch, Sở Giao thông Vận tải tỉnh đã xuất chọn phương án 3 (là phương án có điều chỉnh gia tăng lớn nhất) với các nội dung quy hoạch gồm: quy hoạch toàn bộ khu thành bến container, điều chỉnh bổ sung quy hoạch bến tại một phần khu kho năng lượng sạch gần 198 ha, điều chỉnh bổ sung quy hoạch bến tại khu nước tiềm năng gần 137 ha.
Quy hoạch tổng chiều dài bến 19,6 km bao gồm bến cảng Gemalink 1,52km, bến tổng hợp container Cái Mép Hạ dạng Finger 5,6 km, kéo dài bến hạ lưu Cái Mép Hạ ra ngoài so với quy hoạch 1/2000 đã phê duyệt thêm 12,12 km.
Các ngành cũng khẳng định khu kho năng lượng sạch gần 198 ha hiện chưa có trong quy hoạch nào, do đó cần phải điều chỉnh quy hoạch 1/2000 tại khu kho năng lượng sạch và khu nước tiềm năng. Việc điều chỉnh quy hoạch cục bộ của cảng Cái Mép Hạ hạ lưu thuộc thẩm quyền của Bộ Giao thông Vận tải điều chỉnh quy hoạch 1/2000 đối với phần diện tích khu kho năng lượng sạch và khu nước tiềm năng thuộc thẩm quyền của tỉnh.
Đối với hình thức lựa chọn nhà đầu tư, thống nhất hình thức đấu giá đất, lựa chọn 1 nhà đầu tư cho toàn bộ dự án theo chỉ đạo của Tỉnh ủy.
Được biết Trung tâm Logistics Cái Mép Hạ tại Thị xã Phú Mỹ là một dự án phức hợp với nhiều chức năng chuyên ngành bao gồm: kho bãi, cảng bến thủy nội địa, cảng biển. Mục tiêu dự án nhằm hình thành Trung tâm dịch vụ Logistics cho hàng hóa, đặc biệt là dịch vụ container; thực hiện các dịch vụ thông quan, kiểm định hàng hóa tại chỗ cho hàng hóa xuất nhập khẩu; hình thành và phát triển khu vực trung chuyển, dịch vụ logistics cửa ngõ quốc tế, cảng đầu mối khu vực hiện đại... Qua đó đáp ứng sự phát triển của vận tải biển Việt Nam và thế giới, thu hút hàng hóa luân chuyển trong khu vực.
