Theo đại diện Bộ Giao thông Vận tải, trên cơ sở phân tích, đánh giá tình hình thực tiễn của các doanh nghiệp vận tải hàng hải cũng như doanh nghiệp cảng biển trong dịch COVID-19, tại Thông tư 54/2018 của Bộ Giao thông Vận tải ban hành biểu khung giá dịch vụ hoa tiêu hàng hải, dịch vụ sử dụng cầu bến, phao neo, dịch vụ bốc dỡ container và lai dắt tại cảng biển Việt Nam hiện đã cao hơn trước nhưng còn thấp hơn nhiều so với các nước trong khu vực Đông Nam Á.
Hiện tại Việt Nam, giá bốc dỡ container cao nhất tại các cảng nước sâu như Cái Mép-Thị Vải mới chỉ là 52 USD/container 20feet, 77 USD/ container 40feet nếu so sánh với Campuchia (có hạ tầng cảng biển kém hơn Việt Nam) cũng đang thu khoảng 65 USD/ container 20feet, 99 USD/ container 40feet. Singapore là 111 USD/ container 20feet; 159 USD/ container 40feet.
Đại diện Bộ Giao thông Vận tải khẳng định, việc giảm giá xếp dỡ container sẽ ảnh hưởng tiêu cực đến các doanh nghiệp cảng biển Việt Nam nhưng mang lại lợi ích cho các doanh nghiệp vận tải biển nước ngoài khi các doanh nghiệp này vẫn thu phụ phí cao đối với doanh nghiệp xuất nhập khẩu Việt Nam, phía Bộ Giao thông Vận tải đưa ra quan điểm không xem xét giảm giá dịch vụ xếp dỡ tối thiểu tại cảng biển như đã quy định.
Hiện nay, việc vận chuyển hàng hóa bằng đường biển chủ yếu do các hãng tàu nước ngoài thực hiện, do đó nếu giảm phí, lệ phí sẽ đem lại lợi ích cho các hãng tàu ngoại nhưng làm giảm nguồn thu ngân sách Nhà nước và chỉ hỗ trợ một phần nhỏ doanh nghiệp vận tải trong nước.
Bộ Giao thông Vận tải chỉ đạo Cục Hàng hải Việt Nam cần phối hợp các đơn vị liên quan nghiên cứu kỹ lưỡng, đánh giá tác động, báo cáo Bộ Giao thông Vận tải trước khi có kiến nghị cụ thể Bộ Tài Chính.
Trước đó, nhằm kịp thời tháo gỡ khó khăn cho doanh nghiệp vận tải biển trong thời gian dịch bệnh COVID-19, Cục Hàng hải Việt Nam đã ban hành điều chỉnh giá dịch vụ hoa tiêu hàng hải cho các doanh nghiệp hay chủ tàu thuyền. Cụ thể, đối tượng được giảm giá dịch vụ hoa tiêu hàng hải là tàu thuyền Việt Nam hoạt động tuyến nội địa (bao gồm cả tàu thuyền và phương tiện sông pha biển).