Trước vòng đấu thứ 2, nhiều người đã nghĩ về kịch bản chiến thắng dễ dàng cho Than Khoáng Sản Việt Nam, Phong Phú Hà Nam và Thành phố Hồ Chí Minh. Cả 3 đều chỉ phải đối đầu 3 đội bóng yếu hơn là Sơn La, Thái Nguyên T&T và Hà Nội Watabe II.
Tuy nhiên, thực tế không hoàn toàn diễn ra như vậy khi TP.HCM phải vã mồ hôi trước một Hà Nội Watabe II. Đội bóng thành phố mang tên Bác bế tắc trước khung thành thủ môn đối phương.
Liên tiếp các cơ hội trôi qua trước mũi giày của Huỳnh Như, Bích Thùy và Tuyết Ngân. Các học trò huấn luyện viên Đặng Quốc Tuấn cũng đã có một hiệp đấu chơi đầy quả cảm và đáng khen trước các đàn chị dày dặn kinh nghiệm.
Tuy vậy, khác biệt về đẳng cấp đã lên tiếng trong hiệp 2 trận đấu. Bích Thùy và Thu Thảo liên tiếp chọc thủng lưới đội bóng thủ đô ở phút 79 và 83 của trận đấu sau 2 pha dứt điểm gọn gàng. Với chiến thắng này, TP.HCM có 6 điểm tạm dẫn đầu bảng và giành một tấm vé sớm vào chơi ở bán kết.
Ở 2 trận đấu diễn ra sớm trong khung giờ 17h, Than Khoáng Sản Việt Nam và Phong Phú Hà Nam đều giành chiến thắng dễ dàng trước Thái Nguyên T&T, Sơn La với tỉ số lần lượt là 2-0 và 6-2.
Có được 3 điểm, Hà Nam cùng Hà Nội Watabe I dắt tay nhau vào bán kết. Trận đấu cuối giữa hai đội chỉ mang tính chất phân định ngôi đầu bảng. Còn Than Khoáng Sản Việt Nam sẽ có trận đấu cuối gặp Hà Nội Watabe II. Đội bóng nào giành chiến thắng sẽ cùng TP.HCM bước vào vòng tiếp theo với tư cách đại diện bảng B.
Kết quả lượt trận thứ 2 cúp quốc gia nữ 2020:
Than KSVN vs Thái Nguyên T&T: 2-0
Hà Nội II Watabe vs TP Hồ Chí Minh: 0-2
Apec Sơn La vs Phong Phú Hà Nam: 2-6