Ban chấp hành Công đoàn Trường gồm 15 người. Công đoàn Trường có 14 Công đoàn bộ phận, 12 tổ Công đoàn trực thuộc hoạt động tại 4 địa bàn là Cơ sở Hà Nội, Phân hiệu miền Nam, Viện Đào tạo và Khoa học ứng dụng miền Trung, Cơ sở Phố Hiến.
PGS.TS Nguyễn Ngọc Thắng – Chủ tịch Công đoàn nhà trường cho biết với sự quan tâm, chỉ đạo của Liên đoàn Lao động thành phố Hà Nội và Đảng ủy ban Giám hiệu Trường Đại học Thủy lợi, trong năm học 2019 – 2020, Công đoàn Trường đã thực hiện xuất sắc các nhiệm vụ chức năng của mình.
Công tác chăm lo cho cán bộ công chức viên chức lao động được Nhà trường quan tâm hàng đầu; các hoạt động phong trào phong phú đã tạo không khí thân thiện trong cán bộ, giảng viên. Thời gian phòng, chống dịch COVID-19, Nhà trường đã ủng hộ cho các sinh viên có hoàn cảnh khó khăn, các lưu học sinh đang theo học tại trường, ủng hộ nước rửa tay cho 155 trường tại Hà Nội và các trường lân cận.
Các hoạt động của Công đoàn đã góp phần vào hoàn thành xuất sắc các nhiệm vụ chính của Nhà trường, phương hướng nhiệm vụ nêu trong Nghị quyết Đại hội Công đoàn khóa 29 và Hội nghị Cán bộ viên chức đầu năm học 2019-2020 đề ra, tạo tiền đề quan trọng để hoàn thành xuất sắc mọi nhiệm vụ đặt ra cho năm học tới.
Đoàn khảo sát của Liên đoàn Lao động thành phố Hà Nội đề nghị Công đoàn Trường tiếp tục tăng cường đổi mới công tác tuyên truyền, thực hiện tốt quy chế phối hợp giữa lãnh đạo Nhà trường với Công đoàn, quan tâm công tác phát triển Đảng và kết nạp đoàn viên mới, hỗ trợ những đoàn viên Công đoàn có hoàn cảnh khó khăn trong thời gian tới.
