Công đoàn Các KCX và CN Cần Thơ được thành lập từ tháng 7 năm 1999 có 9 CĐCS với 3.000 đoàn viên. Hiện nay đã có 63 CĐCS với 23.244 đoàn viên.
Theo báo cáo, 6 tháng đầu năm 2019, phong trào công nhân và hoạt động của Công đoàn Các KCX và CN Cần Thơ tiếp tục có nhiểu đổi mới, chuyển biến rõ nét và đạt nhiều kết quả nổi bật, thực hiện tốt chức năng, nhiệm vụ của mình và đóng góp tích cực vào thực hiện nhiệm vụ chính trị của địa phương.
Công tác chăm lo đời sống cho CNVCLĐ được Công đoàn Các KCX và CN Cần Thơ đã vận động các doanh nghiệp trong và ngoài khu công nghiệp tặng và hỗ trợ hơn 21.710 phần quà, tổng kinh phí hơn 1 tỉ đồng và 1.000 thẻ bảo hiểm tai nạn cho CNLĐ.
Trong tháng công nhân năm 2019, Công đoàn các KCX và CN Cần Thơ đã kết nạp 1.000 đoàn viên mới; tặng 100 phần quà và 18.000 phiếu mua hàng giảm giá từ 20% đến 75% giá trị sản phẩm cho đoàn viên và NLĐ; tổ chức đoàn thăm hỏi 26 trường hợp công nhân có hoản cảnh khó khăn, bị tai nạn lao động.
Trong dịp này đã trao 4 bằng khen của Tổng Liên đoàn Lao động Việt Nam cho 2 tập thể và 2 cá nhân; trao 6 bằng khen của LĐLĐ TP Cần Thơ cho 6 cán bộ CĐCS; tặng 2 kỷ niệm chương “Vì sự nghiệp xây dựng tổ chức Công đoàn”; trao 2 mái ấm công đoàn (mỗi căn trị giá 40 triệu) từ Quỹ Tấm lòng vàng Công đoàn Cần Thơ và Đảng ủy khối Doanh Nghiệp TP Cần Thơ hỗ trợ nhà ở cho chị Lê Thị Ngọc Trinh với số tiền 40 triệu.