Trận chung kết hạng cân 55-60kg nam môn pencak silat giữa Muhamad Yachser Arafa (Indonesia) và Muhammad Bin Hazim Yusli, diễn ra rất căng thẳng. Khi trận đấu chỉ còn 28 giây là kết thúc và tỉ số đang là 21-21, Yachser Arafa thực hiện một cú đá trái luật vào mặt Hazim Yusli.
Võ sĩ của Singapore ngay lập tức bị ngã xuống sàn, nằm bất động. Các bác sĩ của Singapore và lực lượng y tế tại Nhà thi đấu Bắc Từ Liêm phải vào sân để sơ cứu cho Hazim Yusli. Võ sĩ Singapore sau đó được đưa rời sân bằng cáng cứu thương. Các trọng tài sau đó đã cho Hazim Yusli thắng trận, bởi Yachser Arafa đã thực hiện cú đá trái luật nên bị truất quyền thi đấu.
Một sự cố khác cũng diễn ra sáng 16.5 tại môn pencak silat, tại chung kết hạng cân 50-55kg nam giữa Khoirudin Mustakim (Indonesia) và Muhammad Bin Azkhar (Malaysia). Cuối trận đấu, Mustakim dẫn đối phương 59-50, nhưng sau đó các trọng tài cho rằng anh đã phạm lỗi khiến đối thủ chấn thương.
Võ sĩ Indonesia bị trừ 10 điểm và thua ngược đối thủ với điểm số 49-50. Bức xúc với quyết định của trọng tài, một thành viên trong ban huấn luyện viên Indonesia đã tranh cãi dữ dội. Lực lượng an ninh sau đó đã phải can thiệp để tránh sự cố đáng tiếc xảy ra. Thành viên ban huấn luyện viên của Indonesia sau đó cũng bị đuổi lên khán đài.
