Sự việc xảy ra vào khoảng 15h, ngày 26.9, theo đó vào khoảng thời gian trên, em B.V.B, học sinh lớp 7B, trường THCS Khánh Vân cùng 5 em khác học cùng trường rủ nhau ra tắm tại ao Nhà xứ Yên Vân (thuộc xóm 2, xã Khánh Vân, huyện Yên Khánh, Ninh Bình).
Trong quá trình tắm, do nước ao sâu, các em lại không biết bơi nên em B đã bị đuối nước. Phát hiện thấy B bị đuối nước, một số em trong nhóm đã nhanh chóng chạy lên bờ để hô hoán mọi người cứu vớt. Tuy nhiên, khi được mọi người vớt lên, em B đã tử vong.
Trước đó, vào ngày 23.9, trên địa bàn huyện Yên Mô, Ninh Bình cũng xảy ra một vụ đuối nước khiến 1 nam sinh trường THPT Yên Mô B tử vong.