Thiệt hại đặc biệt nặng tại các huyện miền núi như; Quan Sơn, Mường Lát, Quan Hóa, Bá Thước, Cẩm Thủy.
Trong đó, huyện Quan Sơn bị nặng nhất, mưa lũ khiến 3 học sinh tại 2 xã Na Mèo và Sơn Thủy bị cuốn trôi (1 em đã tìm thấy thi thể, 2 em hiện vẫn còn mất tích).
Ngoài ra, cũng tại Trường tiểu học Na Mèo (khu bản Sa Ná), gia đình cô giáo Tiếm có bé trai 3 tháng tuổi bị cuốn mất tích và chồng cô bị nước cuốn trôi gãy xương sườn, dập thận và đang được cấp cứu tại Bệnh viện đa khoa tỉnh Thanh Hóa.
Mưa lũ cũng khiến 10 ngôi trường (5 trường mầm non, 3 trường tiểu học, 1 trường TH và 1 trường THCS) tại huyện Quan Sơn bị hư hỏng và vùi lấp. Thiệt hại ước tính trên 8 tỉ đồng.
Cùng với đó, trên địa bàn các huyện Bá Thước có 9 trường học; Mường Lát 9 trường; Quan Hóa 3 trường và Cẩm Thủy 1 trường bị hư hỏng, vùi lấp do mưa lũ gây ra. Theo Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Thanh Hóa, tổng kinh phí đề nghị hỗ trợ cho các trường để khắc phục thiệt hại do mưa lũ khoảng hơn 26 tỉ đồng.
Trước những thiệt hại trên, trong khi năm học mới đang đến gần, Sở Giáo dục và Đào tạo tỉnh Thanh Hóa đang khẩn trương chỉ đạo các đơn vị, trường học huy động tối đa lực lượng tham gia khắc phục hậu quả mưa lũ, đảm bảo cơ sở vật chất để các em tới trường.
Riêng đối với các trường học bị vùi lấp, hư hỏng nặng gây thiếu phòng học thì sẽ lên phương án, tổ chức học 2 ca/ngày, hoặc mượn các nhà văn hóa thôn bản để làm lớp học cho các em.
