Tập cuối bộ phim "Bão ngầm" đặt dấu chấm hết cho hành trình phá án đường dây ma túy xuyên quốc gia của Đại úy Đào Hải Triều và các trinh sát.
Khi bị vây bắt, bác sĩ Hùng hoảng loạn bắt Hạ Lam làm con tin. Nhưng sau đó anh nhanh chóng thả người yêu ra, tự dí súng vào thái dương.
Phút giây từ biệt, Hùng nghẹn ngào: "Tình yêu tôi dành cho em là tất cả con tim tôi. Nhưng nếu có ngày em lừa dối tôi thì tôi sẽ chết". Trước khi bóp cò, Hùng không quên nhìn Lam và nói "anh yêu em".
Vụ án khép lại, thiếu úy Vũ Hạ Lam viết đơn xin nghỉ việc trong hối hận muộn màng. Trong khi đó, Hải Triều và các đồng đội đau đớn khôn nguôi trước sự hi sinh của Đại tá Trọng Hà.
Hải Triều được thăng chức lên hàng Thiếu tá, cùng lúc thông báo Hạ Lam đã nghỉ việc.
Lúc này, Hải Yến ngỏ lời muốn kết hôn với Hải Triều. Cô cho rằng Hải Triều vẫn chưa quên được Hạ Lam, chỉ đến với cô vì trách nhiệm.
Bị Hải Yến nhìn thấu, Triều xin cô cho anh thêm thời gian. Tuy nhiên, nữ thiếu úy từ chối vì cô đã quyết định chuyển công tác đến Tứ Bình để tìm kiếm tình yêu thật sự.
Kết phim tua đến thời điểm một năm sau. Hạ Lam và con trai chuyển đến sống ở vùng núi hoang vu. Khi Hải Triều lên thăm, Lam dặn dò anh bảo trọng, đi công tác an toàn.
Sau cùng, tình yêu nảy nở trong hoàn cảnh khắc nghiệt đều có kết cục bi thương. Sự hi sinh, gan dạ, kiên trì của các chiến sĩ công an nhân dân đã được đền đáp. Tập cuối phim "Bão ngầm" cho thấy các nhân vật đi theo những con đường khác nhau, tiếp tục cuộc sống sau khi chuyên án thành công.
