Cụ thể, Tổng cục chỉ đạo khi làm thủ tục hải quan đối với mặt hàng ôtô áp dụng thuế suất ưu đãi đặc biệt cần lưu ý kiểm tra việc đáp ứng tiêu chí xuất xứ và trong trường hợp có nghi vấn liên quan đến tính hợp lệ của C/O, các thông tin khai báo C/O hay xuất xứ thực tế của hàng hóa nhập khẩu, Cục Hải quan các địa phương phải gửi báo cáo và hồ sơ liên quan về Tổng cục để tiến hành xác minh.
Tổng cục Hải quan đưa ra các dấu hiệu cần phải lưu ý như: có dấu hiệu giả mạo chữ ký, con dấu C/O, sự không phù hợp giữa thông tin về hàng hóa khai báo trên C/O với chứng từ thuộc bộ hồ sơ hải quan, nghi ngờ về tiêu chí xuất xứ trên C/O hay qua kiểm tra thực tế (nếu có) phát hiện xuất xứ thể hiện trên hàng hóa khác so với khai báo, quy định về vận chuyển trực tiếp…
Trong thời gian chờ kết quả xác minh, hàng hóa nhập khẩu không được áp dụng thuế suất ưu đãi đặc biệt mà áp dụng theo mức thuế suất ưu đãi MFN (biểu thuế ưu đãi chung) - mức thuế ưu đãi thấp hơn ưu đãi đặc biệt.
