Đại hội đã thông qua 12 chỉ tiêu cơ bản trong 5 năm tới. Các chỉ tiêu phấn đấu gồm: Kết nạp mới từ 8.000 - 9.000 đoàn viên; hàng năm có 85% trở lên công đoàn cấp trên trực tiếp cơ sở đạt tiêu chuẩn vững mạnh; 5 năm có ít nhất 4.500 lượt cán bộ được đào tạo, bồi dưỡng nghiệp vụ công tác công đoàn; phấn đấu 100% DNNN và 70% trở lên DN ngoài NN có thương lượng và ký kết thỏa ước lao động tập thể, 80% trở lên thỏa ước lao động tập thể có nội dung có lợi; có 80% nữ đoàn viên, lao động nữ và 85% tập thể nữ đạt danh hiệu “Giỏi việc nước, đảm việc nhà”...
Các đại biểu cũng đã thống nhất bầu BCH LĐLĐ tỉnh nhiệm kỳ 2018-2023 gồm 37 người. Ở phiên họp thứ nhất BCH khóa mới đã bầu ra Ban Thường vụ gồm 11 người. Ông Phan Quốc Thắng, Phó Trưởng ban trực, Ban tổ chức Tỉnh ủy được bầu làm Chủ tịch Liên đoàn Lao động tỉnh Phú Yên. Ông Hồ Hồng Nam, ông Huỳnh Kim Hùng và bà Phạm Thị Ngọc Tú tiếp tục được bầu làm Phó Chủ tịch LĐLĐ tỉnh khóa X. Ủy ban Kiểm tra LĐLĐ tỉnh khóa IX có 7 thành viên do ông Trần Quang Đạt làm Chủ nhiệm.
Ban thường vụ nhiệm kỳ mới đã trao tặng những bó hoa tươi thắm thay lời cảm ơn đến bà Nguyễn Thị Thu Vân, Chủ tịch LĐLĐ tỉnh nhiệm kỳ 2013-2018 nghỉ theo Nghị định 26/NĐCP và 16 đồng chí không tham gia BCH nhiệm kỳ mới.