Đầu tháng 11.2019, Trung tâm Kiểm định chất lượng giáo dục - Đại học Quốc gia Hà Nội tiến hành thẩm định báo cáo tự đánh giá. Trung tuần tháng 5.2020, đoàn chuyên gia đánh giá ngoài đã thực hiện đợt Khảo sát chính thức kiểm định chất lượng cơ sở giáo dục tại Trường Đại học Phenikaa.
Cuối tháng 7.2020, sau những quy trình cần thiết, Trung tâm đã ban hành Quyết định cấp Giấy Chứng nhận Kiểm định chất lượng giáo dục cho Trường Đại học Phenikaa.
Tại buổi lễ trao quyết định và giấy chứng nhận đạt kiểm định chất lượng ngày 18.9, ông Lê Mỹ Phong – Phó Cục trưởng Cục Quản lý chất lượng, Bộ GDĐT gửi lời chúc mừng Ban lãnh đạo, các thầy cô giáo và nhất là các em sinh viên của Trường, những người đang được thụ hưởng môi trường giáo dục lành mạnh của một trường đại học đạt chuẩn kiểm định; gia đình các em có thể yên tâm và tự hào rằng con mình đã có một lựa chọn đúng nơi học tập bậc đại học, khởi đầu cho còn đường lập thân, lập nghiệp.
Đồng thời, Phó Cục trưởng cũng đánh giá cao sự tích cực và chủ động của Trường Đại học Phenikaa trong công tác chuẩn bị các điều kiện phục vụ đánh giá ngoài và nhấn mạnh: “Trường Đại học Phenikaa đã tiến hành đánh giá một cách bài bản, được Trung tâm Kiểm định chất lượng giáo dục - Đại học Quốc gia Hà Nội đánh giá ngoài và được công nhận đạt chuẩn chất lượng giáo dục theo bộ tiêu chuẩn mới ban hành gồm 25 tiêu chuẩn và 111 tiêu chí”.
Còn theo Chủ tịch Hội đồng Trường - TS Hồ Xuân Năng - việc đánh giá, kiểm định chất lượng giáo dục là chủ trương lớn của Nhà nước; tạo cơ hội cho các trường đại học nói chung và Trường Đại học Phenikaa nói riêng nhận ra những ưu thế và tồn tại.
Trong thời gian tới, Trường sẽ triển khai hoạt động quản trị Trường theo mô hình doanh nghiệp tri thức với định hướng là trường đại học đổi mới sáng tạo, xuất sắc trong đào tạo, nghiên cứu, chuyển giao công nghệ, khởi nghiệp và hướng nghiệp. Việc đổi mới sáng tạo sẽ đẩy mạnh việc nghiên cứu khoa học, chuyển giao công nghệ.
Kiểm định chất lượng giáo dục là yêu cầu bắt buộc đối với các cơ sở giáo dục Việt Nam. Điều này đã được ghi rõ trong Luật Giáo dục và Luật Giáo dục đại học. Trường Đại học Phenikaa là trường đại học thứ 144 được kiểm định.