Kết luận Thanh tra chỉ ra: Có 7 doanh nghiệp kê khai sai, kê khai thiếu số thuế giá trị gia tăng (GTGT), thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) phải nộp, số tiền 35.065.280.351 đồng.
Trong đó: Thuế GTGT phải nộp tăng so với kê khai 27.339.619.907 đồng: Thuế TNDN phải nộp tăng so với kê khai 7.725.660.444 đồng.
Điển hình như Công ty cổ phần Thủy Điện Bắc Hà kê khai phí lãi vay được trừ khi tính thuế TNDN chưa đúng quy định, dẫn đến thiếu thuế TNDN phải nộp số tiền 6.246.521.309 đồng.
Thanh tra Bộ Tài chính kiến nghị Cục trưởng cục thuế tỉnh Lào Cai tiến hành truy thu thuế và xử lý vi phạm về thuế theo quy định đối với 7 doanh nghiệp số tiền hơn 35 tỉ đồng.
Đồng thời, kiến nghị Cục thuế tỉnh về công tác lập kế hoạch thanh tra, kiểm tra phải lựa chọn các doanh nghiệp có rủi ro cao về thuế (như doanh nghiệp kinh doanh bất động sản, khai thác khoáng sản, doanh nghiệp có quan hệ liên kết, giao dịch liên kết,...) nhằm nâng cao hiệu quả các cuộc thanh tra, kiểm tra.
Thực hiện đầy đủ, nghiêm túc các quy định tại Quy trình thanh tra, kiểm tra tại doanh nghiệp; nâng cao chất lượng công tác kiểm tra tại trụ sở Cơ quan Thuế, kịp thời phát hiện người nộp thuế kê khai không đúng để xử lý theo quy định.
Trong quá trình thanh tra, có 4 doanh nghiệp đã nộp tổng số tiền: 6.343.937.382 đồng vào Ngân sách nhà nước là: Công ty TNHH Xây dựng Thái Lào (5.781.815.727 đồng); Công ty Cổ phần Đầu tư phát triển đô thị 379 Lào Cai (472.365.650 đồng); Công ty TNHH Xây lắp Cương Lĩnh (71.000.000 đồng); Công ty cổ phần sản xuất xuất nhập khẩu Phú Hưng (18.756.005 đồng).
