Theo Thanh tra Chính phủ, từ năm 2005 – 2015, Đại học Ngoại thương không có quy hoạch đối với chức danh Hiệu trưởng, Phó hiệu trưởng, là chưa thực hiện quy định của Đảng về quy hoạch cán bộ.
Trách nhiệm thuộc về Bí thư, Hiệu trưởng, Đảng ủy Đại học Ngoại thương giai đoạn 2005-2015 và Ban Cán sự Đảng (Bộ Giáo dục và Đào tạo) từ 2005-2015.
Giai đoạn 2005-2015, không tiến hành quy hoạch cán bộ thuộc thẩm quyền của Đại học Ngoại thương; ban hành quyết định số 374/QĐ-ĐHNT ngày 28.4.2009 về việc quy hoạch cán bộ năm 2009 và Quyết định số 1135/QĐ-ĐHNT ngày 26.9.2012 về việc quy hoạch cán bộ năm 2012 không đúng quy định tại Khoản 3, mục II và Khoản 6 Mục I Hướng dẫn số 22-HD/BTCTW ngày 21.11.2008 của Ban Tổ chức Trung ương.
Trách nhiệm thuộc về Bí thư, Hiệu trưởng và Đảng ủy Đại học Ngoại thương giai đoạn 2005-2015.
Cũng theo Thanh tra Chính phủ, Hiệu trưởng và Đảng ủy Đại học Ngoại thương đã thực hiện quy trình, đề xuất và Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo đã quyết định bổ nhiệm lại chức danh Phó Hiệu trưởng nhiệm kỳ 2015-2020 khi bà Đào Thị Thu Giang không hoàn thành nhiệm vụ được giao nhiệm kỳ 2010- 2015; vi phạm quy định về điều kiện bổ nhiệm lại công chức trong thời gian giữ chức vụ tại Khoản 1 Điều 19, Quy chế bổ nhiệm, bổ nhiệm lại ban hành theo Quyết định số 5099/QĐ- BGDĐT ngày 19.11.2012 của Bộ GDĐT và Khoản 1 Điều 9 Quy chế bổ nhiệm, bổ nhiệm lại ban hành theo của Quyết định số 27/2003/QĐ-TTg ngày 19.02.2003 của Chính phủ.
Hiệu trưởng và Đảng ủy Đại học Ngoại thương đã thực hiện quy trình, đề xuất và Bộ trưởng Bộ GDĐT đã quyết định bổ nhiệm chức danh Phó Hiệu trưởng nhiệm kỳ 2015-2020 khi bà Lê Thị Thu Thủy không hoàn thành nhiệm vụ được giao nhiệm kỳ 2010-2015.
Thanh tra Chính phủ cũng chỉ ra nhiều sai phạm liên quan tới việc bổ nhiệm, bổ nhiệm lại các chức danh thuộc thẩm quyền của Đại học Ngoại thương giai đoạn từ 2006 – 2015.
Trong đó có 148/153 cán bộ được bổ nhiệm không có quy hoạch; Giai đoạn từ 4.2015 – 9.2018, có 34 trường hợp bổ nhiệm trước khi có quy hoạch được duyệt; 14 trường hợp không có quy hoạch…
Thanh tra Chính phủ chỉ rõ trách nhiệm để xảy ra vi phạm tại Đại học Ngoại thương giai đoạn 2005-2015, trực tiếp là Bí thư đảng ủy, Hiệu trưởng Hoàng Văn Châu, Phó hiệu trưởng Nguyễn Thị Quy, Phó Hiệu trưởng Đào Thị Thu Giang, Trưởng phòng Tổ chức hành chính, Trưởng phòng Kế hoạch Tài chính và các cán bộ tham mưu khác.
Vi phạm trong công tác bổ nhiệm, bổ nhiệm lại, xử lý kỷ luật giai đoạn từ 2015-2017 thuộc trách nhiệm của Hiệu trưởng, Trưởng phòng Tổ chức Hành chính giai đoạn từ 2015-2017.
Về phía Bộ Giáo dục và Đào tạo, Thanh tra Chính phủ cho hay, giai đoạn 2005-2015, Đại học Ngoại thương đã mắc nhiều sai phạm, quá trình giải quyết phản ánh, tố cáo của các cơ quan có thẩm quyền không kịp thời, có nội dung không khách quan; kết quả thanh tra, kiểm tra đã chỉ ra sai phạm nhưng việc xử lý trách nhiệm không đúng quy định, thiếu khách quan, không công bằng là nguyên nhân chính dẫn đến tố cáo kéo dài.
